Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms