Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC15Q0P6D6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms