Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms