Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP4Q07065 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms