Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms