Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	PIN4	YBL051C	2007 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	NSE4	YDL105W	1209 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	RSM28	YDR494W	1086 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	VAB2	YEL005C	849 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	PIR1	YKL164C	1026 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	TRS20	YBR254C	528 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	ADF1	YCL058W-A	342 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	VPS9	YML097C	1356 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	MIS1	YBR084W	2928 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	YSH1	YLR277C	2340 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	YCR013C	YCR013C	648 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	VMA21	YGR105W	234 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	YIP1	YGR172C	747 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	REC104	YHR157W	549 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	BUD19	YJL188C	309 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	YMR187C	YMR187C	1296 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	MFB1	YDR219C	1398 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	KIP3	YGL216W	2418 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	VPS53	YJL029C	2469 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	YDR210W-A	YDR210W-A	1317 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	KRE2	YDR483W	1329 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	YGL063C-A	YGL063C-A	150 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	GOS1	YHL031C	672 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	YHL049C	YHL049C	816 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	ERG9	YHR190W	1335 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	STE18	YJR086W	333 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	MCD4	YKL165C	2760 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	GPI13	YLL031C	3054 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	YLR154W-B	YLR154W-B	165 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	NNT1	YLR285W	786 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	GMC2	YLR445W	567 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	VAC7	YNL054W	3498 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	VBA2	YBR293W	1425 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	Q05541	FAT1	YBR041W	2010 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	KIC1	YHR102W	3243 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	AEP1	YMR064W	1557 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	DIG2	YDR480W	972 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	MTC7	YEL033W	420 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	TMA20	YER007C-A	546 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YER034W	YER034W	558 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	ARF3	YOR094W	552 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	NIP7	YPL211W	546 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	RDS1	YCR106W	2499 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	TCO89	YPL180W	2400 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	VID27	YNL212W	2349 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	AEP2	YMR282C	1743 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	PSP1	YDR505C	2526 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	PEP7	YDR323C	1548 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	NRP1	YDL167C	2160 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	UBX3	YDL091C	1368 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YGR293C	YGR293C	462 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YJR141W	YJR141W	1044 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	ARG80	YMR042W	534 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	IRC21	YMR073C	606 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	INN1	YNL152W	1230 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	MCA1	YOR197W	1299 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YBR300C	YBR300C	498 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YPK9	YOR291W	4419 nt		4.56	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	TRM82	YDR165W	1335 nt		4.56	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	GLC3	YEL011W	2115 nt		4.56	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	VAR1	Q0140	1197 nt		4.56	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	ISA1	YLL027W	753 nt		4.56	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	MTC4	YBR255W	2085 nt		4.56	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	FUS2	YMR232W	2034 nt		4.56	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	ANR2	YKL047W	1551 nt		4.56	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	JEN1	YKL217W	1851 nt		4.56	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	MCM7	YBR202W	2538 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	SEG1	YMR086W	2883 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	APL4	YPR029C	2499 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	MNT4	YNR059W	1743 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	VIP1	YLR410W	3441 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	SLA1	YBL007C	3735 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YDR271C	YDR271C	372 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	THG1	YGR024C	714 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YGR051C	YGR051C	324 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	RPB3	YIL021W	957 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	PRM6	YML047C	1059 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	FRE4	YNR060W	2160 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	HOS3	YPL116W	2094 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	ALG8	YOR067C	1734 nt		4.55	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	CDC45	YLR103C	1953 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	FUN12	YAL035W	3009 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	SYO1	YDL063C	1863 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	STP1	YDR463W	1560 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YFH7	YFR007W	1062 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	MPO1	YGL010W	525 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YGL214W	YGL214W	486 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	QCR10	YHR001W-A	234 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	PBA1	YLR199C	831 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YMR181C	YMR181C	465 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YOR032W-A	YOR032W-A	201 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YRO2	YBR054W	1035 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	DPB3	YBR278W	606 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	SMI1	YGR229C	1518 nt		4.54	□□□□□ -1.68
NSE3	Q05541	YKL050C	YKL050C	2769 nt		4.53	□□□□□ -1.68

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