Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTK2Q05397 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms