Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms