Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLE4Q04727 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TLE4Q04727 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms