Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR3Q03167 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR3Q03167 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms