Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms