Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A11Q02978 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms