Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NHLH2Q02577 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms