Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
XPCQ01831 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
XPCQ01831 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
XPCQ01831 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
XPCQ01831 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
XPCQ01831 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
XPCQ01831 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
XPCQ01831 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
XPCQ01831 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XPCQ01831 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XPCQ01831 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XPCQ01831 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XPCQ01831 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XPCQ01831 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XPCQ01831 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XPCQ01831 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XPCQ01831 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XPCQ01831 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPCQ01831 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPCQ01831 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPCQ01831 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPCQ01831 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPCQ01831 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPCQ01831 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPCQ01831 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
XPCQ01831 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPCQ01831 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XPCQ01831 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XPCQ01831 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XPCQ01831 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XPCQ01831 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XPCQ01831 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XPCQ01831 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XPCQ01831 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XPCQ01831 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XPCQ01831 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XPCQ01831 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XPCQ01831 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XPCQ01831 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XPCQ01831 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XPCQ01831 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
XPCQ01831 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XPCQ01831 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
XPCQ01831 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
XPCQ01831 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XPCQ01831 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XPCQ01831 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XPCQ01831 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XPCQ01831 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XPCQ01831 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPCQ01831 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPCQ01831 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPCQ01831 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPCQ01831 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPCQ01831 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
XPCQ01831 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
XPCQ01831 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPCQ01831 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XPCQ01831 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XPCQ01831 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms