Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUD4Q01804 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms