Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms