Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA4Q00056 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms