Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPCAP84074 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPCAP84074 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPCAP84074 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPCAP84074 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPCAP84074 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPCAP84074 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPCAP84074 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPCAP84074 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms