Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms