Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNRPNP63162 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNRPNP63162 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNRPNP63162 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNRPNP63162 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNRPNP63162 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNRPNP63162 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms