Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms