Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GNB1P62873 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB1P62873 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB1P62873 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB1P62873 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms