Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSNL1P62760 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms