Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UFM1P61960 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFM1P61960 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFM1P61960 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFM1P61960 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms