Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms