Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5BP61020 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms