Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFC1-1P60608 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms