Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3S2P59780 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3S2P59780 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms