Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP107P57740 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP107P57740 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP107P57740 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP107P57740 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP107P57740 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP107P57740 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP107P57740 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP107P57740 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms