Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms