Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF10P55107 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GDF10P55107 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF10P55107 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF10P55107 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF10P55107 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF10P55107 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF10P55107 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF10P55107 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF10P55107 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF10P55107 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF10P55107 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms