Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms