Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1B3P54709 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1B3P54709 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms