Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNP53814 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMTNP53814 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMTNP53814 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMTNP53814 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMTNP53814 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNP53814 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMTNP53814 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMTNP53814 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms