Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms