Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL12P52815 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms