Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNA2P51530 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNA2P51530 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNA2P51530 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNA2P51530 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNA2P51530 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNA2P51530 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNA2P51530 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNA2P51530 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNA2P51530 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNA2P51530 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNA2P51530 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNA2P51530 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNA2P51530 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNA2P51530 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms