Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBP2P50120 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBP2P50120 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBP2P50120 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBP2P50120 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBP2P50120 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBP2P50120 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBP2P50120 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RBP2P50120 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBP2P50120 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBP2P50120 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBP2P50120 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBP2P50120 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBP2P50120 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBP2P50120 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBP2P50120 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBP2P50120 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBP2P50120 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBP2P50120 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBP2P50120 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBP2P50120 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBP2P50120 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBP2P50120 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBP2P50120 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RBP2P50120 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBP2P50120 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBP2P50120 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBP2P50120 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms