Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms