Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPAP49450 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPAP49450 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPAP49450 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPAP49450 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPAP49450 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPAP49450 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPAP49450 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPAP49450 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPAP49450 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPAP49450 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPAP49450 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPAP49450 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPAP49450 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPAP49450 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms