Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI2P48788 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms