Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME1P48163 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ME1P48163 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ME1P48163 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ME1P48163 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ME1P48163 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME1P48163 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME1P48163 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME1P48163 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME1P48163 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME1P48163 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ME1P48163 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME1P48163 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME1P48163 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ME1P48163 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME1P48163 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME1P48163 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME1P48163 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms