Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR1P43307 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR1P43307 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR1P43307 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR1P43307 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR1P43307 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR1P43307 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSR1P43307 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSR1P43307 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSR1P43307 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms