Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC5P40937 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC5P40937 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFC5P40937 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFC5P40937 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC5P40937 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC5P40937 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC5P40937 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC5P40937 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC5P40937 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC5P40937 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC5P40937 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC5P40937 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC5P40937 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC5P40937 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC5P40937 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC5P40937 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RFC5P40937 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFC5P40937 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFC5P40937 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFC5P40937 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms