Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF4A3P38919 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4A3P38919 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms