Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP62P37198 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP62P37198 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP62P37198 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP62P37198 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP62P37198 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP62P37198 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP62P37198 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP62P37198 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP62P37198 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP62P37198 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP62P37198 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP62P37198 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP62P37198 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP62P37198 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP62P37198 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP62P37198 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP62P37198 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP62P37198 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP62P37198 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP62P37198 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP62P37198 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms