Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms