Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH5P33151 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH5P33151 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH5P33151 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH5P33151 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms