Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMLP26374 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMLP26374 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMLP26374 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMLP26374 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMLP26374 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMLP26374 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMLP26374 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMLP26374 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMLP26374 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMLP26374 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMLP26374 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMLP26374 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMLP26374 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMLP26374 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMLP26374 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMLP26374 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMLP26374 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMLP26374 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMLP26374 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMLP26374 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMLP26374 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMLP26374 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMLP26374 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMLP26374 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMLP26374 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CHMLP26374 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMLP26374 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMLP26374 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMLP26374 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMLP26374 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMLP26374 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMLP26374 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMLP26374 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMLP26374 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMLP26374 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMLP26374 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMLP26374 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms