Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO2P25791 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO2P25791 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO2P25791 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO2P25791 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO2P25791 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO2P25791 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO2P25791 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO2P25791 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO2P25791 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO2P25791 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO2P25791 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO2P25791 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMO2P25791 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO2P25791 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO2P25791 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms